Comme tous les autres marais niortais, les Marais de Saint-Rémy et de Chey présentent un fort intérêt biologique.
Les marais niortais abritent plusieurs espèces protégées. Parmi les mammifères: la loutre, le campagnol amphibie, des chauve-souris (noctule de Leisler , noctule commune, murin à moustaches, murin de Daubenton). Parmi les libellules : l'agrion mignon. Parmi les plantes : l'hottonie des marais.
Les vallées sèches, dont fait partie la vallée de Buffevent Torfou, sont des milieux très diversifiés de Niort. Elles accueillent 89% des papillons niortais, dont l'azuré du serpolet, la mélitée orangée, la mélitée des scabieuses, le demi-argus, et 63% des reptiles niortais.
